本网讯(文、图/禹小波)近日,生命科学学院禹小波课题组在植物科学领域知名期刊《Frontiers in plant science》(IF=6.627,JCR Q1,Top期刊)在线发表题为“Phylogenetic and AlphaFold predicted structure analyses provide insights for A1 aspartic protease family classification in Arabidopsis”的原创性研究论文,在拟南芥天冬氨酸蛋白酶家族的分类与进化上做出重要成果。
生命科学学院教师段延玲为论文第一作者,禹小波教授为第一通讯作者。该成果得到了卡塔尔世界杯决赛波胆预测 、生命科学学院、科研部、竹类病虫防控与资源开发四川省重点实验室相关领导、老师和学生们的鼎力支持。
天冬氨酸蛋白酶在植物的生长、发育和防御过程中发挥着重要的作用,因此天冬氨酸蛋白酶家族的分类对于认识其蛋白功能与进化发挥着重要作用。在本研究中,我们创新性的采用AlphaFold预测的高准确性蛋白结构,并结合12个物种的进化关系分析,对拟南芥的70个天冬氨酸蛋白酶成员进行了重新分类。新的分类将天冬氨酸蛋白酶分为4个group,其中group IV是在被子植物中广泛存在的一个特殊group,这一group不具有传统的DTSG和DSGT活性位点,因而在之前的研究中往往被忽视。因此,这一类群的鉴定与分类对于天冬氨酸蛋白酶家族的分类与进化具有重要意义。